Zu 1) und 2)
Meinst du die Traits oder Ethos? Die Traits wie „Schwach“ „Schlau“ usw. sind leicht ausnutzbar.
Ich empfehle den Trait der Anführern einen extra Skill gibt, mehr Forschung, schnelle Vermehrung. Als negativ Skills kann man Schwach nehmen (Auswirkungen sind minimal und wenn es dazu kommt ist es entweder eh zu spät oder es schadet nicht mehr) und das Gegenteil von nomadisch - keine Ahnung wie das im Deutschen heißt.
Ethos musst du mit deinem Spielstil und Gewissen vereinbaren 
Ich habe gute Erfahrung mit fanatisch materialistisch und gemeinschaftlich gemacht. Als nächstes möchte ich Fanatisch Spirituell probieren. Vom gewählten Ethos hängt auch die verfügbare Regierungsform ab. Eventuell überlegst du dir, welche du haben möchtest und suchst dann die passenden Ethos aus.
Custom Rassen haben keine Vor- oder Nachteile. Sie sind halt nur an das angepasst was du spielen möchtest. Es gibt sicherlich auch unsinnige Kombinationen aber ich finde bei Stellaris muss man sich damit abfinden, dass der Zufall nicht immer zu eigenen Gunsten liegt.
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Bis ich ein Kolonieschiff bauen konnte, hatte ich in der Regel schon ne Menge Planeten gefunden und andere Kontakte. Generell solltest du die erste Kolonie einfach bauen, sobald es geht, es aber nicht schnellstmöglich erzwingen. Wenn du die Auswahl hast, achte drauf dass die Kolonie in einer Ecke der Galaxie liegt, in die du auch expandieren willst. Also entweder weg von anderen Imperien oder geredewegs hinein. Auch immer drauf achten was für Systeme um die Kolonie herum liegen, denn durch die Expansion deiner Nation, kannst du dann dort auch neue Ressourcen abbauen.
Eine Kolonie in leerem Raum bringt am Ende nicht viel.
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Alle Ressourcen werden verteil, außer Nahrung. Die gilt nur für den jeweiligen Planeten.
Später wirst du dein Imperium auch in Sektoren aufteilen müssen. Die Sektoren verwalten sich autonom und du legst nur den Fokus wieder. Zum Beispiel ein Sektor für Forschung oder Mineralienabbau.
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Nun. Früh anfangen aufzurüsten. Ich habe mir angewöhnt schon sehr früh eine Flotte von 10 Korvetten zu bauen und mit einem Admiral aufzuwerten, der die Geschwindigkeit der Schiffe steigert. Damit kann man nicht nur die zahlreichen Weltraummonster „zähmen“ sondern sich auch etwaiger Konkurrenten erwehren.
Auch hier ist wieder der Zufall entscheidend. Startest du neben einem gefallenen Imperium oder einem, das bereits einen Vorsprung hast, siehts schwer aus.
Generell: fang in ner kleinen Galaxie mit wenigen KI Gegnern an um die Mechaniken zu lernen. Dabei ruhig das Tutorial anlassen.
) Der Management- und forschungsteil ist dafür mmn deutlich besser, als bei EUIV, sodass sich das ausgleicht.